2006年，在黨中央、國務院的正確領導下，各地各部門認真貫徹落實中央關于新時期環保工作的部署，不斷加大工作力度，全國環保工作取得積極進展。國務院發布《關于落實科學發展觀加強環境保護的決定》，第六次全國環保大會精神深入人心，各項工作穩步推進，污染減排工作取得積極進展，環境監管明顯加強，突發環境事件得到妥善處置，最廣泛的環保“統一戰線”正在形成，歷史性轉變邁出堅實步伐，呈現出領導高度重視、部門認真落實、社會廣泛參與、成效初步顯現的喜人局面，環保事業煥發出空前的生機與活力。
雖然環保工作取得了積極進展，但環境形勢依然嚴峻，不斷發生的污染事件給群眾生產生活帶來嚴重的影響，環境壓力持續加大。
2006年，全國廢水排放總量為536.8億噸，比上年增加2.3%。其中，工業廢水排放量240.2億噸，占廢水排放總量的44.7%，比上年減少1.1%；城鎮生活污水排放量296.6億噸，占廢水排放總量的55.3%，比上年增加5.8%。廢水中化學需氧量排放量1428.2萬噸，比上年增加1.0%。其中，工業廢水中化學需氧量排放量541.5萬噸，占化學需氧量排放總量的37.9%，比上年減少2.4%；城鎮生活污水中化學需氧量排放量886.7萬噸，占化學需氧量排放總量的62.1%，比上年增加3.2%。廢水中氨氮排放量141.3萬噸，比上年減少5.7%。其中，工業氨氮排放量42.5萬噸，占氨氮排放量的30.0%，比上年減少19.0%；生活氨氮排放量98.8萬噸，占氨氮排放量的70.0%，比上年增加1.6%。工業廢水排放達標率92.1%，比上年下降0.5個百分點，工業用水重復利用率80.6%，比上年提高4.5個百分點。
2006年，全國廢氣中二氧化硫排放量2588.8萬噸，比上年增加1.5%。其中，工業二氧化硫排放量為2234.8萬噸，占二氧化硫排放總量的86.4%，比上年增加3.1%；生活二氧化硫排放量354.0萬噸，占二氧化硫排放總量的13.6%，比上年減少7.1%。煙塵排放量1088.8萬噸，比上年減少7.9%。其中，工業煙塵排放量864.5萬噸，占煙塵排放總量的79.5%，比上年減少8.9%；生活煙塵排放量224.3萬噸，占煙塵排放總量的20.5%，比上年減少4.0%。工業粉塵排放量808.4萬噸，比上年減少11.3%。工業燃料燃燒二氧化硫排放達標率和工業生產工藝二氧化硫排放達標率分別為82.3%和81.0%，分別比上年增加1.4%和10.0%。全國工業固體廢物產生量15.2億噸，比上年增加12.7%；工業固體廢物綜合利用率為59.6%，比上年提高6.7個百分點；工業固體廢物排放量1302.1萬噸，比上年減少21.3%。
截至2006年底，我國已建成生態示范區試點地區和單位528個。其中，已命名的國家級生態示范區233個，全國環境優美鄉鎮178個。已建各種類型、不同級別的自然保護區2395個，總面積15153.5萬公頃，約占國土面積的15.8%。
2006年，全國環境污染治理投資為2567.8億元，比上年增長7.5%，占當年GDP的1.23%，達到歷史最高。其中，工業污染源污染治理投資485.7億元，比上年增長6.0%；建設項目“三同時”環保投資767.2億元，比上年增加19.1%；城市環境基礎設施建設投資1314.9億元，比上年增長1.9%。
一．廢水排放及治理
1．廢水排放總量（億噸） 536.8
其中：工業廢水排放量 240.2
城鎮生活污水排放量 296.6
2．化學需氧量排放總量（萬噸） 1428.2
其中：工業化學需氧量排放量 541.5
城鎮生活化學需氧量排放量 886.7
3．氨氮排放總量（萬噸） 141.3
其中：工業氨氮排放量 42.5
城鎮生活氨氮排放量 98.8
4．工業廢水排放達標率（%） 92.1
5．工業用水重復利用率（%） 80.6
6．城市污水處理率（%） 57.1
其中：城市生活污水處理率（%） 43.8
二．廢氣排放及其治理
1．二氧化硫排放總量（萬噸） 2588.8
其中：工業二氧化硫排放量 2234.8
生活二氧化硫排放量 354.0
2．煙塵排放總量（萬噸） 1088.8
其中：工業煙塵排放量 864.5
生活煙塵排放量 224.3
3．工業粉塵排放量（萬噸） 808.4
4．工業燃料燃燒SO2排放達標率（%） 82.3
5．工業生產工藝SO2排放達標率（%） 81.0
三．工業固體廢物
1．工業固體廢物產生量（萬噸） 151541.4
2．工業固體廢物綜合利用量（萬噸） 92601.0
3．工業固體廢物綜合利用率（%） 59.6
4．工業固體廢物貯存量（萬噸） 22398.1
5．工業固體廢物處置量（萬噸） 42883.0
6．工業固體廢物排放量（萬噸） 1302.1
7．“三廢”綜合利用產品產值（億元） 1026.8
四．環境污染治理投資
1．污染治理項目投資總額（億元） 2567.8
其中： 工業污染治理項目投資額 485.7
“三同時”項目環保工程投資額 767.2
城市環境基礎設施建設投資額 1314.9
2．環境污染治理投資占當年GDP（%） 1.23
五．工業污染治理
1．當年施工污染治理項目數（個） 13101
2． 污染治理項目當年完成投資額（億元） 483.9
其中：治理廢水 151.1
治理廢氣 231.3
治理固體廢物 18.2
治理噪聲 3.0
治理其他 78.3
六．自然生態保護
1．自然保護區數（個） 2395
其中：國家級 265
省級 793
市級 422
縣級 915
2．自然保護區面積（萬公頃） 15153.5
3．保護區面積占國土面積比（%） 15.8
4．珍稀瀕危動物繁殖場數（個） 164
5．珍稀植物引種栽培場數（個） 77
6．生態示范區試點地區和單位數（個） 528
7．已命名國家級生態示范區數（個） 233
8．已命名全國環境優美鄉鎮數（個） 178
七．環境管理
（一）環境法制
1．當年制定環境保護部門規章數（件） 7
2． 當年頒布環境保護地方性法規數（件） 38
3． 當年頒布環境保護地方性政府規章數（件） 41
4． 當年實施的環境行政處罰案件數（起） 92404
5． 當年受理的環境行政復議案件數（起） 208
6． 當年結案的環境行政訴訟案件數（起） 353
7．當年發生的環境行政賠償案件數（起） 15
8．當年結案的環境犯罪案件數（起） 4
（二）排污收費
1．交納排污費單位數（萬個） 67.1
2．排污費征收總額（億元） 144.1
（三）建設項目環境影響評價
1．當年辦理設立的建設項目數（個） 364779
2．向環保部門履行申報手續項目數（個） 12922
3．環境影響評價制度執行率 （%） 99.7
（四）“三同時”執行
1．當年應執行“三同時”項目數（個） 81988
2．實際執行“三同時”項目數（個） 81480
3．“三同時”合格項目數（個） 74842
4．“三同時”執行合格率 （%） 91.3
5．“三同時”項目投資總額 （億元） 76463.7
其中:環保工程實際投資 767.2
（五）限期治理
1．當年完成限期治理項目數（項） 20578
2．完成限期治理項目投資額（億元） 237.9
3．關停并轉企業數（個） 10030
（六）城市環境治理
1．煙塵控制區數（個/平方公里） 3512/41195.1
2．環境噪聲達標區（個/平方公里） 4037/28875.5
(七) 環境科技
1．當年設立的科研課題數（項） 3466
2．當年獲科學技術獎勵數（項） 101
其中： 國家級 2
省（部）級一等 7
省（部）級二等 34
省（部）級三等 58
3．國家環保總局當年制定環境保護標準數(項) 118
累積制定各類環境保護標準數（項） 1007
4．當年頒布地方環境標準數（項） 24
（八）來信來訪
1．本年來信總數（封） 616122
2．當年已處理來信數（封） 576151
3．本年來訪批次（批） 71287
4．當年已處理來訪批次 （批） 62166
5．各級人大、政協環保議案、提案數 10295
6．已辦理人大、政協環保議案、提案數 10253
（九）污染與破壞事故
1． 環境污染與破壞事故次數（次） 842
其中：水污染 482
大氣污染 232
海洋污染 10
固體廢物污染 45
噪聲與振動危害 6
其他 67
2．污染與破壞事故直接經濟損失（萬元） 13471.1
八、環保系統能力建設
1．各級環保系統機構數（個） 11321
其中：國家級 41
省級 352
地市級 2005
縣級 7680
鄉鎮 1243
2．各級環境監測站數（個） 2322
其中：國家級 1
省級 39
地市級 396
縣級 1886
3．各級環境監察機構數（個） 2803
其中： 國家級 1
省級 32
地市級 404
縣級 2366
4．各級環境科研所數（個） 260
其中：國家級 3
省級 30
地市級 227
5．各級環保系統實有人數（人） 170290
其中：國家級 2065
省級 10911
地市級 43084
縣級 109839
鄉鎮 4391
6．各級環境監測人員數（人） 47689
其中：國家級 108
省級 2825
地市級 16143
縣級 28613
7．各級環境監察機構人員數（人） 52845
其中：國家級 45
省級 772
地市級 9169
縣級 42859
說明：各項統計數據未包括香港和澳門特別行政區以及臺灣省。